濟南大學現有數學科學學院、物理科學與技術學院、材料科學與工程學院、化學化工學院、機械工程學院、土木建筑學院、自動化與電氣工程學院、信息科學與工程學院、水利與環境學院、生物科學與技術學院、設計學院、標準化產業學院等12個理工科學院。學校建有省部級以上科技創新平臺35個，其中省部共建協同創新中心1個、教育部工程研究中心1個、省級重點實驗室3個、省協同創新中心4個、省級工程實驗室3個、省級行業實驗室1個、省級工程技術研究中心12個、省技術創新中心5個、省級國際科技合作研究中心1個、省產業創新中心1個、地方專業性技術創新平臺1個、省基礎科學研究中心培育基地1個、省工程研究中心1個。
學校高度重視科研工作，不斷深化科研管理體制改革，科研工作不斷取得新突破。近年來，學校共承擔國家重點研發、國家自然科學基金等國家級科研課題640項，省部級項目1064項；獲得省部級以上科研獎勵245項，其中獲國家技術發明二等獎2項、國家科學技術進步二等獎2項；獲得國家發明專利3337項；學術論文被SCI、EI、ISTP、CPCI-S收錄7304篇；材料科學、化學、工程學、臨床醫學、環境學及生態學、生物及生物化學等6個學科進入全球ESI前1%；主辦《中國粉體技術》、《濟南大學學報》（自然科學版）等2種學術期刊。
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